La segunda temporada se estrenó el 13 de septiembre de 2005 y terminó el 23 de mayo de 2006. Durante la temporada, House trata de lidiar con sus sentimientos hacia su ex-novia Stacy Warner, quien, después de que House diagnostica a su esposo con "porfiria aguda intermitente", acepta un trabajo en el departamento legal del hospital. La química entre Sela Ward y Laurie en los últimos dos episodios de la primera temporada fue lo suficientemente fuerte como para hacer que el personaje regresara por siete episodios de la segunda. La temporada fue un éxito de audiencias; "No Reason" fue visto por 25,47 millones de espectadores, el número más alto de la historia del programa hasta ese momento.3 La segunda temporada promedió 17,3 millones de espectadores por episodio, superando a la primera por un 30%. Esto la convirtió en el décimo programa más visto en la temporada televisiva 2005–2006.
Episodios (24)
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Episodio 1
0 Aceptación -
Episodio 2
0 Autopsia -
Episodio 3
0 Humpty Dumpty -
Episodio 4
0 Es o no es -
Episodio 5
0 El niño de papá -
Episodio 6
0 Dar vueltas -
Episodio 7
0 Caza -
Episodio 8
0 El error -
Episodio 9
0 Engaño -
Episodio 10
0 Problemas de comunicación -
Episodio 11
0 Necesidad de saber -
Episodio 12
0 Distracciones -
Episodio 13
0 No es oro todo lo que reluce -
Episodio 14
0 El sexo mata -
Episodio 15
0 Sin pistas -
Episodio 16
0 A salvo -
Episodio 17
0 Apuesto el resto -
Episodio 18
0 El sueño de los justos -
Episodio 19
0 House contra dios -
Episodio 20
0 Euforia (Parte 1) -
Episodio 21
0 Euforia (Parte 2) -
Episodio 22
0 Para siempre -
Episodio 23
0 ¿Quién es tu padre? -
Episodio 24
0 Sin razón